Zamonaviy neyrofiziologiyaning dolzarb muammolaridan biri bu katta yarim sharlar qobig'ining miyaning subkortikal tuzilmalari bilan aloqasi. Ushbu tuzilmalar orasida funktsional ko'rinishlarining xilma-xilligi bilan ajralib turadigan va adaptiv xatti-harakatlarning kompozit reaktsiyalarining emotsional va motivatsion, somatik va vegetativ tarkibiy qismlarini tartibga solishda muhim rol o'ynaydigan gipotalamus alohida o'rin tutadi.