В статье рассмотрены вопросы разработки новых научно-методологических подходов к процессу налогового контроля при трансфертном ценообразовании по реализации комплексной государственной налоговой политики. Грамотное формирование системы трансфертного ценообразования позволит приобрести необходимый контроль над процессом, разработать оперативные решения, выявить возможности, отклонения и тренды в отношении отдельных транзакций и более крупных операций по ним.