Ирсий, екзоген, мултифакториал омиллар аёл жинсий органларининг ривожланишидаги аномалияларнинг сабабларига олиб келади. Genital малформацияларнинг пайдо бўлиши интраутерин ривожланишнинг муҳим даврига боғлиқ. Парамесонефрал Мюллер каналчалари каудал бўлимларининг термоядровий бўлмаслигига, урогенитал sinus трансформацияларидаги оғишларга, шунингдек гонад органогенезининг патологик кечишига асосланган бўлиб, бу бирламчи нуктанинг ривожланишига боғлиқ. Бу оғишлар барча аномалияларнинг 16% ини ташкил етади. Жинсий аъзолар ривожланишининг аномалиялари кўпинча ҳомиладорликнинг турли даврларида онада ҳомиладорликнинг патологик кечишида юзага келади. Бу ерта ва кеч гестоз, юқумли касалликлар, интоксикация, онанинг танасида ендокрин касалликлар. Бундан ташқари, аёллар жинсий аъзоларининг ривожланишидаги аномалиялар зарарли екологик омиллар, онадаги касбий зарарли таъсирлар, токсик моддалар билан заҳарланиш таъсирида юзага келиши мумкин. Жинсий аъзолар аномалиялари билан бир қаторда 40% ҳолларда сийдик тизими аномалиялари (бир томонлама буйрак агенези), ичаклар (анус атрезияси), суяклар (туғма сколиоз), шунингдек туғма юрак нуқсонлари кузатилади.